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lianxh
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连享会新命令:cnssc
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⛳ Stata 系列推文:
作者:Bethune 学院
邮箱:bethune0507@163.com
目录
诊断试验是指用于确定或排除疾病的方法。这里泛指临床上所进行的各种实验室检验、器械检查和影像学检测。基本方法是将待评价的诊断试验和标准诊断 (金标准 gold standard) 做比较性研究。将受检对象 (可疑病例) 按标准诊断法分为患某病组与未患某病组,用待评价的诊断试验把结果分为阳性和阴性,汇入四格表,然后分别计算各种结果的发生概率。
评价指标需要满足真实、可靠、简单、易行四个要求。
灵敏度 (sensitivity,Se):又称真阳性率,是实际患病且被诊断试验正确判为该病患者的百分比,即患者被判为阳性的概率。反映检出患者的能力,该值愈大愈好。
漏诊率 (omission diagnostic rate,β):又称假阴性率,是实际患病而被诊断试验错误诊断为非患者的百分比,即患者被判为阴性的概率。
特异度 (specificity,Sp):又称真阴性率,是实际未患病被诊断试验正确判为非患者的百分比,即非患者被判为阴性的概率。反映鉴别非患者的能力,该值愈大愈好。
误诊率 (mistake diagnostic rate,α):又称假阳性率,是实际未患病而被诊断试验错误诊断为患者的百分比,即非患者中被判为阳性的概率。
预告值:又称预测值,预检值,检验结果的正确率。阳性预告值 (+PV) 是阳性结果中真阳性所占的百分比,它表示当诊断试验结果为阳性时患有该病的概率。
阴性预告值 (-PV) 是阴性结果中真阴性所占的百分比,它表示当诊断试验结果为阴性时未患该病的概率。
似然比 (likelihood ratio,LR):又称预测值,预检值,检验结果的正确率。是诊断试验的结果在患者中出现的概率与在非患者中出现的概率之比。
重复性、稳定性、可靠性 (reliability)、可重复性 (repeatability),表示在完全相同的情况下,进行重复操作获得结果彼此接近的程度,反映诊断试验的稳定性。测量中的变异是普遍存在的,几乎不可避免,应做出估计。影响可靠性的因素:
评价可靠性指标:
二者不是必定相关的。真实性好,不一定可靠性也好。特别要注意,可靠性虽好,但并不真实的结果。
约登指数 (Youden’s Index,YI),又称正确指数,其值越大,真实性越好。
提高其中一个,必降另一个,恰当地选择截断点,兼顾 Se 和 Sp。
PV:直观易理解,但受患病率影响; LR:率比,不如 PV 直观,但稳定,更推荐使用。
ROC (receiver operating characteristic curve) 又称受试者工作特征曲线,是以取不同阳性判断标准时的灵敏度为纵坐标,误诊率 (1-特异度) 为横坐标绘制所得的曲线。它表示灵敏度与特异度之间的相互关系。比如将上述糖尿病诊断试验的灵敏度和 1-特异度得到的数值点画在坐标轴上,然后将无数个这样的点连接起来,就组成了 ROC 曲线。
AUC (Area Under Curve) 被定义为 ROC 曲线下的面积,显然这个面积的数值不会大于 1。又由于 ROC 曲线一般都处于 y=x 这条直线的上方,所以 AUC 的取值范围一般在 0.5 和 1 之间。
roctab refvar classvar [if] [in] [weight] [, options]
refvar
定义诊断金标准,有无糖尿病;classvar
定义诊断的手段,比如血糖,等连续变量。. webuse hanley, clear
. roctab disease rating
ROC Asymptotic normal
Obs area Std. err. [95% conf. interval]
------------------------------------------------------------
109 0.8932 0.0307 0.83295 0.95339
. webuse hanley
. roctab disease rating, graph
. webuse hanley, clear
. roctab disease rating, table detail
True |
disease |
status of | rating
subject | 1 2 3 4 5 | Total
-----------+-------------------------------------------------------+----------
0 | 33 6 6 11 2 | 58
1 | 3 2 2 11 33 | 51
-----------+-------------------------------------------------------+----------
Total | 36 8 8 22 35 | 109
Detailed report of sensitivity and specificity
------------------------------------------------------------------------------
Correctly
Cutpoint Sensitivity Specificity classified LR+ LR-
------------------------------------------------------------------------------
( >= 1 ) 100.00% 0.00% 46.79% 1.0000
( >= 2 ) 94.12% 56.90% 74.31% 2.1835 0.1034
( >= 3 ) 90.20% 67.24% 77.98% 2.7534 0.1458
( >= 4 ) 86.27% 77.59% 81.65% 3.8492 0.1769
( >= 5 ) 64.71% 96.55% 81.65% 18.7647 0.3655
( > 5 ) 0.00% 100.00% 53.21% 1.0000
------------------------------------------------------------------------------
ROC Asymptotic normal
Obs area Std. err. [95% conf. interval]
------------------------------------------------------------
109 0.8932 0.0307 0.83295 0.95339
Note:产生如下推文列表的 Stata 命令为:
lianxh DID, m
安装最新版lianxh
命令:
ssc install lianxh, replace
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